1990-е
В 1990-е годы появляются новые темы исследований у научных сотрудников музея. Начинается сбор экспонатов по следующим темам: «смоляне – узники фашистских лагерей», «смоляне – воины-интернационалисты и участники локальных войн», «смоляне в истории Российского флота». В связи с расширением сферы исследований отдел становится военно-историческим. В музее проходят многочисленные собрания и мероприятия.
Происходит постоянное пополнение фондов музея уникальными экспонатами. Так, в 1994 году в музей французской делегацией было передано знамя полка «Нормандия - Неман».
Несмотря на трудности, которые музей переживал вместе со всей страной в начале 1990-х годов, благодаря усилиям научных сотрудников не прекращалась научная и просветительская деятельность музея.